La historia cuenta el mágico y escalofriante relato de Lewis (Owen Vaccaro), un niño de 10 años quien, tras quedar huérfano, se muda a la vieja y rechinante casa de su tío que tiene un misterioso reloj. Pronto, la aburrida y tranquila vida de su nuevo pueblo se ve interrumpida cuando accidentalmente, Lewis despierta un mundo secreto.

Entre las costumbres raras de su tío destaca su modo de pasear por la casa durante altas horas de la noche apagando los distintos relojes que se encuentran en las habitaciones. Queriendo así evitar, que su sobrino lo crea demente. Jonathan (Jack Black) le cuenta que antes de comprar la mansión cinco años atrás, ésta pertenecía a un mago malvado llamado Isaac Izard.